近年のゲノムシーケンシング技術の向上は、生物多様性の理解にも革命をもたらし続けています。身近な生物に対してゲノム分析を適用することで、その自然史を解像度高く理解し、保全や利用に応用することが現実的になっています。
大貫渓介 理学研究科博士課程学生（現：国立遺伝学研究所日本学術振興会特別研究員（PD））、渡辺勝敏 同教授、田畑諒一 琵琶湖博物館学芸員、三品達平 九州大学助教、西田睦 東京大学名誉教授の研究グループは、伊勢湾・三河湾周辺にのみ生息する日本固有種の淡水魚で絶滅危惧種でもあるネコギギ（ナマズ目ギギ科）についてゲノム分析を行い、従来の遺伝分析では見いだせなかった本種の地域集団分化の歴史を明らかにしました。ネコギギは湾周辺の河川の中・上流部に分布し、生息地改変により絶滅の危機に瀕する地域集団を多く抱える種ですが、遺伝的多様性の低さのため、地域集団間の関係はほとんど分かっていませんでした。本研究では、現存するネコギギは、海水準が低下し湾全体が陸地となった最終氷期には単一の集団を形成しており、最終氷期半ばから後氷期の海水準上昇が生じた数千年前にかけて集団分化したことが分かりました。集団分化の過程で、地域集団はまず伊勢湾奥部と湾口部周辺に分化したと推定され、特に湾口部の集団にあたる現在の湾をまたいだ東西の集団が遺伝的に近い関係を示しました。こうした集団分化のパターンは、現在の湾部にかつて存在した、大きな古水系による河川の連結を強く反映していると考えられます。本研究は、古水系が作り出したネコギギの地域集団の多様性をゲノム分析によって解明し、分布形成の歴史を踏まえた生物多様性の保全の重要性を提示するものです。
本研究成果は、2026年3月26日に、国際学術誌「Ecology and Evolution」にオンライン掲載されました。
研究者のコメント
「夜の川に現れるネコギギは、流れに逆らってゆらゆらと、ときに力強く進む姿がユニークな魚です。この魚がもつ歴史の一端を知ることができたことを嬉しく思います。本研究で用いたサンプルの中には、私が生まれた頃に収集されたものもありました。生き物たちの長い歴史に思いを馳せながら、自然史研究の歴史も繋いでいきたいです。」（大貫渓介）
「ネコギギの研究を始めた学部生のころから40年近い年月が流れました。ポスドク時代に集め始めた貴重なサンプルを使って、若い人たちと一緒に最新の手法で解析し、まとめ上げることができました。ネコギギと共にあった若き日の研究生活を熱く思い起こします。」（渡辺勝敏）
【DOI】
https://doi.org/10.1002/ece3.73263
【書誌情報】
Keisuke Onuki, Ryoichi Tabata, Tappei Mishina, Mutsumi Nishida, Katsutoshi Watanabe (2026). Genome-Wide Analysis Successfully Resolves Population Structure Shaped by Recent Divergence in the Endangered Bagrid Catfish Pseudobagrus ichikawai. Ecology and Evolution, 16, 4, e73263.
