光照射を用いた超高解像度な遺伝子解析技術の開発に成功 -組織内に潜むがん細胞の病理診断などに応用可能-

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 沖真弥 医学研究科特定准教授、大川恭行 九州大学教授らの研究グループは、光単離化学(Photo-Islation Chemistry=PIC)という技術を開発し、非常に小さな細胞集団や細胞の中の微小構造体で機能する遺伝子を光照射により検出することに成功しました。

 ヒトやその他の多細胞生物は少なくとも100種類以上の細胞タイプから構成され、空間的な配置や場所によってさらに細分化された機能や特性を持つことが知られています。一方で、これらの細胞を臓器や組織から取り出すと本来の特性を失うため、組織を破壊することなく特定の細胞のみを解析する必要がありますが、従来の手法では不可能とされてきました。

 本研究グループは、半導体製造工程の光による超微細加工技術をヒントに、光を照射したエリアからのみ、遺伝子の発現情報を取り出す(=単離する)技術を開発しました。PICと名付けられたこの技術により、脳のさまざまな領域に光を照射して、領域ごとに働きが異なる遺伝子のみを検出することに成功しました。さらにマウス胎児の非常に小さな細胞集団や、従来不可能であった細胞内の1000分の1ミリ以下の微小構造体からも遺伝子を網羅的に検出することができました。

 空間オミクスと呼ばれる研究分野の成果である本技術分野は、現在、国際的な開発競争が激化しています。こうした技術の多くは、利用に高額の費用を要しますが、PICは既存の遺伝子解析手法にたった数百円追加するだけで実施できるため、国際的な普及が見込まれる日本発の独自技術です。今後、この技術によってがんやCOVID-19による炎症など、正常と異常な細胞が入り混じった臨床組織の病理診断への応用が加速すると期待されます。

 本研究成果は、2021年7月21日に、国際学術誌「Nature Communications」に掲載されました。

PICの原理
図:PICの原理(1)光開裂性ブロッカーのついたプライマーを切片に滴下する。その後、逆転写反応によって遺伝子のRNAがDNAに変換される。(2)目的の細胞に光照射すると、プライマーからブロッカーが外れる。(3)光照射した細胞の遺伝子だけが増幅される。
研究者情報
書誌情報

【DOI】https://doi.org/10.1038/s41467-021-24691-8

【KURENAIアクセスURL】http://hdl.handle.net/2433/264604

Mizuki Honda, Shinya Oki, Ryuichi Kimura, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Kaori Tanaka, Chikara Meno, Yasuyuki Ohkawa (2021). High-depth spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry. Nature Communications, 12:4416.