2013年9月30日まで
2013年4月1日から
| 総長 | 松本 紘 |
| 理事 | 赤松 明彦 |
| 理事 | 淡路 敏之 |
| 理事 | 江﨑 信芳 |
| 理事 | 小寺 秀俊 |
| 理事 | 西阪 昇 |
| 理事 | 三嶋 理晃 |
| 理事 | 吉川 潔 |
| 法務・コンプライアンス担当副学長 | 林 信夫 |
| 文学研究科長 | 服部 良久 |
| 理学研究科長 | 有賀 哲也 |
| 生命科学研究科長 | 石川 冬木 |
| 再生医科学研究所長 | 岩田 博夫 |
| 国立大学法人政策研究大学院大学教授 独立行政法人科学技術振興機構社会技術研究開発センター長 | 有本 建男 |
| 独立行政法人日本学術振興会理事長 学校法人慶應義塾 学事顧問 | 安西 祐一郎 |
| 西日本電信電話株式会社取締役相談役 | 大竹 伸一 |
| 東海旅客鉄道株式会社代表取締役会長 |  |
| 京都市長 | 門川 大作 |
| 神戸市立医療センター中央市民病院長 | 北 徹 |
| 独立行政法人国立美術館理事 兼 事務局長 | 小松 弥生 |
| 立命館大学教授 | 土岐 憲三 |
| 新関西国際空港株式会社代表取締役会長 | 福島 伸一 |
| 株式会社国際電気通信基礎技術研究所相談役 | 畚野 信義 |
| 株式会社堀場製作所最高顧問 | 堀場 雅夫 |
| 株式会社森精機製作所取締役社長 | 森 雅彦 |
| 京都府知事 | 山田 啓二 |