役員会
役員会は、中期目標についての意見及び年度計画に関する事項や、予算の作成及び執行並びに決算に関する事項、重要な組織の設置・廃止及び変更に関する事項、その他重要な規則の制定・改廃に関する事項などを審議します。
経営協議会
経営協議会は、法人の経営に関する重要事項について審議します。
教育研究評議会
教育研究評議会は、京都大学の教育研究に関する重要事項を審議します。
部局長会議
部局長会議は、京都大学の経営及び教育研究を円滑に行うために必要な連絡、調整及び協議を行います。
このほか、研究科長部会、総長選考・監察会議などがあります。