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京都大學承續創校以來所建立之自由學風，同時為解決多元課題，對地球社會的和諧共存有所貢獻，以自由與和諧為基礎，訂定此基本理念。
研究
- 京都大學以自由與自主 的 研究為基礎，透過符合高學術倫理的研究活動，創造領先全球的知識。
- 京都大學為一所綜合型大學，要多方發展並整合基礎與應用研究、融合文理的研究。
教育
- 京都大學在多樣且取得協調的教育體系下，以對話為基礎鼓勵學生自主學習，致力於卓越知識的傳承與創造精神之涵養。
- 京都大學要培養有涵養、高尚人格、有負責感、對地球社會和諧共存有所貢獻之優秀研究人員以及具高度專業能力的人才。
社會責任
- 京都大學作為一所開放的大學，在加強與日本以及在地社會合作的同時，要將奠基於自由與和諧所發展出之知識傳播於社會。
- 京都大學作為一所放眼世界的大學，要加深國際交流，為地球社會的和諧共存做出貢獻。
經營理念
- 京都大學為貢獻學術之自由發展，尊重教育研究組織的獨立性，同時致力於全校單位的和諧。
- 京都大學關懷環境、尊重人權的經營理念，同時也負起社會責任。
（2001年12月4日訂定）