2014年10月1日から
| 総長 | 山極 壽一 |
| 理事 | 阿曽沼 慎司 |
| 理事 | 稲葉 カヨ |
| 理事 | 北野 正雄 |
| 理事 | 佐藤 直樹 |
| 理事 | 杉万 俊夫 |
| 理事 | 清木 孝悦 |
| 理事 | 湊 長博 |
| 文学研究科長 | 川添 信介 |
| 理学研究科長 | 有賀 哲也 |
| 生命科学研究科長 | 石川 冬木 |
| 経済研究所長 | 溝端 佐登史 |
| 独立行政法人 国際農林水産業研究センター理事長 | 岩永 勝 |
| びわこ成蹊スポーツ大学 学長 | 嘉田 由紀子 |
| 一般社団法人 構想日本代表 | 加藤 秀樹 |
| 京都市長 | 門川 大作 |
| 株式会社京都新聞社代表取締役社長 主筆 | 黒田 清喜 |
| 大学共同利用機関法人人間文化研究機構 理事 | 小長谷 有紀 |
| 豊田工業大学 学長 | 榊 裕之 |
| 大学共同利用機関法人 自然科学研究機構長 | 佐藤 勝彦 |
| 公益財団法人 ヒューマンサイエンス振興財団会長 | 竹中 登一 |
| 京都信用金庫理事長 | 増田 寿幸 |
| 京都府知事 | 山田 啓二 |
| 大谷大学教授 | 鷲田 清一 |