明治

2年 5月 大阪に舎密局(せいみきょく)開校
  9月 大阪に洋学校開校
3年 10月 理学所(舎密局の後身)、洋学校と合併し、開成所と改称
13年 12月 大阪専門学校(開成所の後身)、大阪中学校と改称
18年 7月 大阪中学校、大学分校と改称
19年 4月 大学分校、第三高等中学校と改称
22年 8月 第三高等中学校、大阪から京都へ移転
27年 9月 第三高等中学校、第三高等学校と改称
30年 6月 京都帝国大学創設
  9月 理工科大学開設
32年 9月 法科大学、医科大学開設
  12月 附属図書館設置
  12月 医科大学附属医院設置
39年 9月 文科大学開設

大正

3年 7月 理工科大学が分けられ工科大学、理科大学となる
8年 2月 分科大学を学部と改称
  5月 経済学部設置
12年 11月 農学部設置
13年 3月 学生健康相談所設置
  5月 農学部附属農場設置
  5月 農学部附属演習林設置
15年 10月 化学研究所附置

昭和

14年 8月 人文科学研究所附置
16年 3月 結核研究所附置
  11月 工学研究所附置
19年 5月 木材研究所附置
21年 9月 食糧科学研究所附置
22年 10月 京都帝国大学を京都大学と改称
24年 5月 新制京都大学設置
  5月 教育学部設置
  5月 第三高等学校を統合
  5月 医学部附属医院を医学部附属病院と改称
  8月 分校設置
  8月 学生健康相談所を保健診療所と改称
25年 3月 第三高等学校廃止
  5月 宇治分校開設
26年 4月 防災研究所附置
28年 4月 新制大学院設置
  8月 基礎物理学研究所附置
29年 3月 分校を教養部と改称
30年 7月 新制大学院医学研究科設置
31年 4月 ウイルス研究所附置
35年 4月 薬学部設置
36年 5月 宇治分校廃止
  5月 工業教員養成所設置
37年 4月 経済研究所附置
38年 4月 教養部設置
  4月 数理解析研究所附置
  4月 原子炉実験所附置
40年 4月 東南アジア研究センター設置
41年 4月 保健管理センター設置
42年 6月 霊長類研究所附置
  6月 結核研究所を結核胸部疾患研究所と改称
44年 4月 大型計算機センター設置
45年 3月 工業教員養成所廃止
46年 4月 放射性同位元素総合センター設置
  4月 工学研究所を原子エネルギー研究所と改称
47年 5月 体育指導センター設置
50年 4月 医療技術短期大学部設置
51年 5月 ヘリオトロン核融合研究センター設置
  5月 放射線生物研究センター設置
52年 4月 環境保全センター設置
  7月 埋蔵文化財研究センター設置
53年 4月 情報処理教育センター設置
55年 4月 医用高分子研究センター設置
56年 4月 超高層電波研究センター設置
61年 4月 アフリカ地域研究センター設置
63年 4月 遺伝子実験施設設置
  4月 結核胸部疾患研究所を胸部疾患研究所と改称
  12月 国際交流センター設置

平成

2年 3月 医用高分子研究センター廃止(10年時限)
  6月 生体医療工学研究センター設置
  6月 留学生センター設置(国際交流センター廃止)
3年 4月 大学院人間・環境学研究科設置
  4月 生態学研究センター設置
  4月 木材研究所を木質科学研究所と改称
4年 10月 総合人間学部設置
5年 3月 教養部廃止
6年 6月 高等教育教授システム開発センター設置
8年 3月 アフリカ地域研究センター廃止(10年時限)
  4月 大学院エネルギー科学研究科設置
  4月 アフリカ地域研究資料センター設置
  4月 学生懇話室設置
  5月 原子エネルギー研究所とヘリオトロン核融合研究センターを統合しエネルギー理工学研究所に改組・転換
9年 4月 総合博物館設置
  4月 総合情報メディアセンター設置(情報処理教育センター廃止)
10年 4月 大学院アジア・アフリカ地域研究研究科設置
  4月 大学院情報学研究科設置
  4月 胸部疾患研究所と生体医療工学研究センターを統合し再生医科学研究所に改組・転換
11年 4月 大学院生命科学研究科設置
  6月 学生懇話室をカウンセリングセンターに改組
12年 4月 超高層電波研究センターを宙空電波科学研究センターに改組
  11月 大学文書館設置
13年 4月 食糧科学研究所廃止(大学院農学研究科と統合)
  4月 国際融合創造センター設置
14年 3月 大学情報収集・分析センター設置
  4月 大学院地球環境学舎・学堂設置
  4月 大型計算機センターと総合情報メディアセンターを統合し学術情報メディアセンターに改組・転換
  4月 低温物質科学研究センター設置
  4月 福井謙一記念研究センター設置
15年 4月 高等教育研究開発推進機構設置
  4月 高等教育研究開発推進センター設置
  4月 高等教育教授システム開発センター廃止
  4月 フィールド科学教育研究センター設置
  4月 農学研究科附属演習林廃止
  4月 体育指導センター廃止
  10月 医学部保健学科設置
16年 4月 国立大学法人京都大学設立
    法学研究科基礎法学専攻、公法専攻、民刑事専攻、政治学専攻を法政理論専攻、国際公共政策専攻(修士課程)、法曹養成専攻(修士課程、法科大学院)に改組
  4月 木質科学研究所と宙空電波科学研究センターを統合し生存圏研究所に改組・転換
  4月 東南アジア研究センターを廃止・転換し、東南アジア研究所附置
  4月 遺伝子実験施設廃止
  12月 大学情報収集・分析センター廃止
17年 4月 環境安全保健機構設置
  4月 国際イノベーション機構設置
  4月 国際交流推進機構設置
  4月 情報環境機構設置
  4月 図書館機構設置
  4月 留学生センターを国際交流センターに改組
18年 4月 大学院公共政策連携研究部・公共政策教育部設置
  4月 大学院経営管理研究部・経営管理教育部設置
  4月 地域研究統合情報センター設置
  4月 ナノメディシン融合教育ユニット設置
  4月 生存基盤科学研究ユニット設置
  7月 次世代開拓研究ユニット設置
  9月 女性研究者支援センター設置
19年 4月 こころの未来研究センター設置
  4月 先端医工学研究ユニット設置
  4月 生命科学系キャリアパス形成ユニット設置
  4月 医療技術短期大学部廃止
  7月 国際イノベーション機構廃止
  7月 産官学連携本部設置
  7月 国際融合創造センターを産官学連携センターに改組
  10月 物質-細胞統合システム拠点設置
20年 4月 野生動物研究センター設置
  4月 埋蔵文化財研究センター廃止
  4月 文化財総合研究センター設置
  4月 宇宙総合学研究ユニット設置
  10月 先端技術グローバルリーダー養成ユニット設置
21年 9月 次世代研究者育成センター設置
22年 3月 学際融合教育研究推進センター設置
  4月 iPS細胞研究所設置
  4月 産官学連携センター廃止(産官学連携本部に統合)
  4月 ナノメディシン融合教育ユニット廃止
  4月 先端医工学研究ユニット廃止
  4月 生命科学系キャリアパス形成ユニット廃止
23年 4月 放射性同位元素総合センター廃止(環境安全保健機構に統合)
  4月

環境保全センター廃止(環境安全保健機構に統合)

  4月 国際交流センター廃止(国際交流推進機構に統合)
  4月

保健管理センター廃止(環境安全保健機構に統合)

  4月 生存基盤科学研究ユニット廃止
  4月 次世代開拓研究ユニット廃止
24年 4月 次世代研究者育成センターを白眉センターと改称
25年 4月 大学院総合生存学館設置
  4月 高等教育研究開発推進機構廃止
  4月 国際高等教育院設置
  4月 先端技術グローバルリーダー養成ユニット廃止
  4月 宇宙総合学研究ユニット廃止
  8月 カウンセリングセンター廃止
  8月 学生総合支援センター設置
26年 4月 女性研究者支援センター廃止
  4月 男女共同参画推進本部設置
27年 4月 研究連携基盤設置
28年 4月 低温物質科学研究センター廃止(環境安全保健機構に統合)
  4月 国際交流推進機構廃止
  4月 国際戦略本部設置
  4月 高等研究院設置
  10月 再生医科学研究所とウイルス研究所を統合しウイルス・再生医科学研究所に改組
29年 1月 東南アジア研究所と地域研究統合情報センターを統合し東南アジア地域研究研究所に改組
  4月 物質−細胞統合システム拠点を高等研究院物質−細胞統合システム拠点に改組
30年 4月 放射線生物研究センター廃止(大学院生命科学研究科に統合)
  4月 原子炉実験所を複合原子力科学研究所と改称
  4月 大学院横断教育プログラム推進センター設置
  10月 高等研究院ヒト生物学高等研究拠点設置
31年 4月 文化財総合研究センター廃止(文学研究科に統合)

令和 

1年 7月 オープンイノベーション機構設置
3年 10月 大学院教育支援機構設置
4年 4月 ウイルス・再生医科学研究所を医生物学研究所と改称
  4月 こころの未来研究センターを人と社会の未来研究院に改組
  4月 霊長類研究所改編、ヒト行動進化研究センター設置
  4月 犬山キャンパス運営協議会設置
  4月 学生総合支援センターを学生総合支援機構に改組
  4月 大学院横断教育プログラム推進センター廃止 (大学院教育支援機構に統合)
  10月 学術研究支援室を学術研究展開センターに改組
  10月 高等教育研究開発推進センター廃止